Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms