Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms