Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Setd4P58467 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms