Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dpf3P58269 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Dpf3P58269 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Dpf3P58269 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Dpf3P58269 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Dpf3P58269 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dpf3P58269 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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