Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Irf5P56477 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms