Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23aP54726 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms