Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apobec1P51908 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms