Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa8P50706 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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