Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtbrP50284 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LtbrP50284 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbrP50284 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms