Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VdrP48281 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VdrP48281 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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VdrP48281 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VdrP48281 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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VdrP48281 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VdrP48281 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VdrP48281 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VdrP48281 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
VdrP48281 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VdrP48281 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VdrP48281 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VdrP48281 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
VdrP48281 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VdrP48281 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VdrP48281 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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