Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gli1P47806 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms