Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdkn1bP46414 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms