Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf1P39428 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf1P39428 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf1P39428 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms