Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig1P37913 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms