Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprkP35822 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprkP35822 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprkP35822 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprkP35822 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprkP35822 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms