Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddit3P35639 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms