Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd1P33215 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms