Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rom1P32958 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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