Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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