Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pabpc1P29341 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms