Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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