Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxrgP28705 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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