Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RdxP26043 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RdxP26043 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RdxP26043 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RdxP26043 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms