Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms