Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkchP23298 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkchP23298 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PrkchP23298 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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