Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms