Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms