Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Fcer1aP20489 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Fcer1aP20489 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Fcer1aP20489 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Fcer1aP20489 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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