Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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Rpl13aP19253 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Rpl13aP19253 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Rpl13aP19253 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rpl13aP19253 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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