Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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PtpraP18052 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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PtpraP18052 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtpraP18052 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms