Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms