Protein–RNA interactions for Protein: P16882

Ghr, Growth hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhrP16882 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GhrP16882 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GhrP16882 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
GhrP16882 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GhrP16882 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GhrP16882 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GhrP16882 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms