Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms