Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Calb1P12658 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms