Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
DmdP11531 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
DmdP11531 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DmdP11531 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
DmdP11531 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
DmdP11531 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DmdP11531 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DmdP11531 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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DmdP11531 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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DmdP11531 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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DmdP11531 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DmdP11531 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms