Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms