Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P10404 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P10404 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P10404 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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