Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms