Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms