Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtaP09225 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtaP09225 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtaP09225 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtaP09225 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtaP09225 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtaP09225 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtaP09225 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtaP09225 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtaP09225 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtaP09225 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtaP09225 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtaP09225 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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