Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Spta1P08032 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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