Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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