Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms