Protein–RNA interactions for Protein: P01812

Ig heavy chain V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01812 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01812 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01812 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01812 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01812 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01812 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01812 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01812 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01812 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01812 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01812 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01812 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms