Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp2O88554 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp2O88554 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms