Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hcn4O70507 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn4O70507 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms