Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp4O70480 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms