Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2f6O54917 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms