Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag2O35638 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stag2O35638 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stag2O35638 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms