Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1mwO35599 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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